В 1998 году при Воронежском епархиальном управлении создан отдел по работе с Армией. С 2009 года его возглавляет священник Николай Бабич настоятель храма во имя свт.Антония (Смирницкого), архиеп.Воронежского и Задонского гом Тенистый г.Воронежа. Отдел по работе с Армией взаимодействует с благочинными церковных округов, настоятелями и клириками храмов Воронежско-Борисоглебской епархии, Воронежской Православной Духовной Семинарией (ВПДС), епархиальными отделами:
- по взаимодействию с правоохранительными органами;
- по работе с молодежью;
- религиозного образования и катехизации;
- миссионерским;
- издательским

Отдел ведет работу в воинских частях и подразделениях Министерства Обороны (МО), Министерства чрезвычайных ситуаций (МЧС), Федеральной пограничной службы (ФПС), Федерального агентства правительственной связи и информации (ФАПСИ), Министерства внутренних дел (МВД), военных учебных заведениях и учреждениях, областном и районных военных комиссариатах, находящихся на территории Воронежско-Борисоглебской епархии, в сфере патриотического и нравственного воспитания личного состава, духовного окормления, просвещения и социальной защиты военнослужащих и членов их семей, реализации их религиозных потребностей.

В областях патриотического и нравственного воспитания личного со­става, духовного окормления и просвещения военнослужащих и членов их семей проводятся следующие мероприятия:
- регулярные встречи священнослужителей с командирами, заместителями командиров по воспитательной работе воинских частей и учебных заведений (для обсуждения вопросов взаимодействия и практического проведения совме­стных мероприятий);
- духовно-назидательные, просветительские, патриотические и индивиду­ально-пастырские беседы священнослужителей с военнослужащими;
- духовные напутствия священнослужителей (с совершением молебных пений):
а) молодому пополнению воинских частей и учебных заведений в ходе проведения ритуала принятия Военной присяги;
б) военнослужащим перед отбытием в районы «горячих точек» и выполне­нием других ответственных задач;
в) личному составу перед началом учебного процесса и после окончания обучения, выпускникам институтов в ходе проведения ритуала выпуска моло­дых офицеров;
г) военнослужащим в ходе проведения ритуала вручения оружия (освяще­ние оружия);
- участие священнослужителей в армейских торжествах, в праздновании знаменательных дат в истории России, Вооруженных Сил, воинских частей и учебных заведений:

23 февраля - День защитников Отечества
9 мая - День Победы
28 мая - День пограничников
12 июня - День независимости России
4 октября - День гражданской обороны
10 ноября - День милиции
27 декабря - День образования МЧС и др.

- участие священнослужителей в сборах заместителей командиров по вос­питательной работе, профессорско-преподавательского состава институтов по проблемам воинского и патриотического воспитания военнослужащих (Гарнизонный дом офицеров (ГДО), Военный институт радиоэлектроники (ВИРЭ) г. Воронеж). В рамках сборов проводятся занятия с офицерами по темам: «История взаимодействия Русской Православной Церкви и Российской Армии», «Со­трудничество Русской Православной Церкви и Российской Армии в современных условиях», «Православие и другие религии» (для подготовки офицерского корпуса с более широким кругозором в вопросах религиоведения), «Тоталитарные секты и опасность их проникновения в Вооруженные Силы»;
- проведение священнослужителями и преподавателями Воронежской Православной Духовной Семинарии факультативных занятий с личным соста­вом институтов на тему «История и роль Православия» в целях изучения истории Православия в России, разъяснения основных понятий Русской Православной культуры, показа исторического аспекта взаимодействия Армии и Церкви в России, развития духовно-нравственных и патриотических качеств личности воина;
- создание в библиотеках воинских частей и учебных заведений отделов православной литературы и пополнение их духовной литературой и церковными периодическими изданиями;
- показ видеофильмов православного и патриотического содержания в во­инских частях и учебных заведениях, обеспечения аудио- и видеоматериалами (в отделе по работе с Армией работает электронная библиотека, прокат видео- и аудиокассет и лазерных дисков);
- экскурсии военнослужащих и членов их семей по православным храмам и монастырям епархии: Алексиево-Акатов монастырь, Задонские монастыри, Дивногорский монастырь и др.
- освящение вооружения, техники, казарменных и других помещений, учебных корпусов, госпиталей, воинских музеев, зданий управлений ГО и ЧС, зданий областного и районных военных комиссариатов.

Вышеуказанные мероприятия способствуют возрождению православных традиций Российской Армии, позволяют использовать духовно-нравственный потенциал Русской Православной Церкви в деле патриотического и нравственного воспитания военнослужащих и оказывают большое влияние в процессе оздоровления нравственного климата в воинских коллективах, профилактики нарушений воинской дисциплины, искоренения неуставных взаимоотношений и других негативных явлений. Оказывают помощь командованию воинских час­тей в формировании морально-психологической устойчивости военнослужащих (в боевой обстановке и чрезвычайных ситуациях), содействуют воспита­нию у воинов нравственной мотивации военной службы, способности к само­отдаче, подвигу на благо Родины.

- регулярные встречи священнослужителей с областным и районными во­енными комиссарами и их заместителями по воспитательной работе;
- духовно-патриотические беседы священнослужителей с призывниками, духовные напутствия призывникам перед отправкой в Вооруженные Силы Российской Федерации (с совершением молебных пений);
- участие священнослужителей в работе военных комиссариатов и заседаниях областных и районных приемных комиссий по решению текущих вопро­сов комплектации и духовного становления Вооруженных Сил Российской Федерации;
- духовное окормление воспитанников кадетских корпусов города Воронежа (Воронежский Великого князя Михаила Павловича кадетский корпус, Морской кадетский корпус «Петр Великий»), ведутся занятия по Закону Божьему.

- пастырские посещения раненых и больных военнослужащих, находящих­ся на излечении в госпиталях и лазаретах, православное духовенство оказывает помощь в психологической реабилитации воинов, получивших ранения и травмы;
- совершение для больных воинов церковных Таинств и обрядов (крещение, исповедь, соборование, причащение и др.);
- беседы священнослужителей с больными воинами и медперсоналом;
- собеседования по психологической реабилитации с военнослужащими и членами их семей при обострении проблем морально-психологического характера;
- индивидуально-пастырская воспитательная работа с военнослужащими, нарушающими воинскую дисциплину, а также имеющими отклонения от норм поведения;
- совместное проведение благотворительных акций и ритуальных мероприятий для оказания социальной, моральной и духовной поддержки ветеранам ВОВ и воинских частей, семьям погибших воинов;
- совершение панихид по павшим воинам в храмах, воинских частях и у братских могил погибших;
- организация летнего оздоровительного отдыха детей малообеспеченных семей военнослужащих в Православном лагере «Кристалл» (пос. Дубовка).

- регулярные посещения священнослужителями военнослужащих (по согласованию с командованием воинских частей) и совершение для них и для членов их семей церковных Таинств и обрядов;
- регулярные богослужения в храмах и молельных комнатах при воинских частях;
- участие военнослужащих в богослужениях, совершаемых в храмах епархии в праздничные дни, в дни поминовения усопших воинов;
- совершение церковных Таинств и обрядов для военнослужащих и членов их семей в храмах епархии.

Работа священнослужителей в воинских частях и учебных заведениях служит обогащению духовной и нравственной жизни воинских коллективов, способствует воспитанию военнослужащих и членов их семей в духе любви к Отечеству, готовности к его защите, развитию милосердия и благотворительности, веротерпимости, гражданской ответственности и патриотизма.